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realign在线播放_realignment of business focus(2024年11月免费观看)

内容来源：冲顶技术团队所属栏目：导读更新日期：2024-11-28

realign

fMRI空间校正全攻略：Realign篇在fMRI数据分析中，时间校正（Slice Timing）和空间校正（Realign）是两个重要的预处理步骤。今天，我们将深入探讨空间校正的原理和方法。 𐟔 空间校正的必要性空间校正主要针对被试在实验过程中产生的头动，如轻微的点头或位移。通过将大脑的移动参数化，并进行回归分析，我们可以减少这些运动对数据的影响。 𐟓š 代码设置与参数准备首先，我们需要设置文件夹和参数。以下是示例代码： ```matlab clc; clear; ANiiFolder = 'E:\work\BlackDog_Brain_Notes\fMRI_Notes\Processed_data\SlicedNii\'; RealignFolder = 'E:\Work\BlackDog_Brain_Notes\fMRI_Notes\Realign\'; RunList = dir([ANiiFolder '*Fun*']); nRun = length(RunList); SubList = dir([ANiiFolder RunList(1).name filesep 'Sub*']); nSub = length(SubList); ``` 𐟛 ️ 循环与批量处理接下来，我们通过循环来处理每个run和每个被试的数据。以下是详细的代码： ```matlab for runi = 1:nRun for subi = 1:nSub SubNiiFolder = [ANiiFolder filesep RunList(runi).name filesep SubList(subi).name]; FileList = dir([SubNiiFolder filesep 'a*.nii']); nFile = length(FileList); load([RealignFolder 'Realign_Batch.mat']); for filei = 1:nFile matlabbatch{1, 1}.spm.spatial.realign.estwrite.data{1, 1}{filei, 1} = [SubNiiFolder filesep FileList(filei).name]; end spm_jobman('run', matlabbatch); end end ``` 𐟓 文件整理与保存最后，我们将整理好的文件保存到指定的文件夹中。这一步可以作为作业留给大家，如果需要具体代码，可以参考图6。通过以上步骤，我们完成了fMRI数据的空间校正。希望这段学习笔记能帮助你更好地理解Realign的概念和方法。

黑狗脑科笔记：详解fMRI&Coreg 最近终于开始忙碌自己的科研项目，每天除了固定的健身时间，加上我本来就有点懒，结果导致间歇性拖更。最近组会PPT卡住了，需要清空脑子更新一下。我们还是和以前一样，打开SPM选择Coregister：Estimate（图1左）。这里选estimate是因为normalize的时候还会写一次，这里就不写了。打开后，我们看到batch窗口（图1右），老样子，在Reference和Source Image中随便放一张图片，Other Image中随便放两三张图片，其它参数不改，保存为“Coregister_batch”。把这个文件重新拉进MATLAB以后，我们一直点击变量栏，就可以得到图2的变量名。接下来进入代码，不懂的函数可以回看之前的笔记：第一步：设置参数 RAFolder='E:\work\BlackDog_Brain_Notes\fMRI_Notes\Processed_data\RA\'; （Realign后的像） T1Folder='E:\work\BlackDog_Brain_Notes\fMRI_Notes\Processed_data\T1Img\'; （结构像） MeanFolder='E:\work\BlackDog_Brain_Notes\fMRI_Notes\Processed_data\MeanImg\'; （平均像） SessionList=dir([RAFolder '*Fun*']); nSession=length(SessionList); SubList=dir([T1Folder 'Sub*']); nSub=length(SubList); 第二步：batch循环 for sessioni=1:nSession for subi=1:nSub load('E:\work\BlackDog_Brain_Notes\fMRI_Notes\Coregister\Coregister_Batch.mat'); （加载我们刚刚保存的batch） T1List=dir([T1Folder SubList(subi).name filesep '*.nii']); matlabbatch{1, 1}.spm.spatial.coreg.estimate.ref{1, 1}=[T1Folder SubList(subi).name filesep T1List(1).name];（refrence是结构像） MeanList=dir([MeanFolder filesep SessionList(sessioni).name filesep SubList(subi).name filesep '*.nii']); matlabbatch{1, 1}.spm.spatial.coreg.estimate.source{1, 1}=[MeanFolder filesep SessionList(sessioni).name filesep SubList(subi).name filesep MeanList(1).name];（配准的是平均像） FileFolder=[RAFolder filesep SessionList(sessioni).name filesep SubList(subi).name filesep]; FileList=dir([FileFolder '*.nii']); nFile=length(FileList); for filei=1:nFile matlabbatch{1, 1}.spm.spatial.coreg.estimate.other{filei, 1}=[FileFolder FileList(filei).name];（others是对应的任务功能像） end spm_jobman('run',matlabbatch); clear matlabbatch; end end 希望这些笔记对大家有帮助，继续加油！𐟒ꀀ

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