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转录本最新娱乐体验_转录从3还是5端开始(2024年11月深度解析)

内容来源：冲顶技术团队所属栏目：话题更新日期：2024-11-29

转录本

CRISPR-Cas13系统是一种新型RNA编辑工具，具有高效、精准的RNA切割和调控功能，在遗传疾病治疗、核酸检测、RNA成像和转录组调控等领域具有广泛应用前景。 1.RNA编辑 Cas13蛋白在crRNA的引导下可特异性编辑RNA，无需PAM序列，切割精准。 2.作用机制 CRISPR-Cas13系统通过适应、表达和干扰三个阶段发挥作用，包括识别crRNA、切割RNA和识别靶RNA。 3.应用现状 Cas13蛋白在核酸检测、RNA成像和转录组调控等领域展示出巨大的应用潜力。 4.未来发展 CRISPR-Cas13系统对于研究重要基因、基因特定转录本、非编码RNA等至关重要，具有极大的研究前景。以上内容由AI检索𐟧 生成，你也可以捏合屏幕𐟤生成属于你的专属内容 @捏一下小助手

近日，「华大智造」中国客户体验中心举办了第一期DCS平台科研赋能体验班活动。基于国际领先的技术平台，本次体验班包含了理论介绍和实操演示两个部分。理论课程包括《基因组学技术原理》、《华大智造单细胞一站式平台介绍》和《华大时空组学技术与时空云平台介绍》；实操演示部分则涵盖了DNBelab C-TaiM 4 单细胞液滴生成仪液滴生成、MGISP-100自动化建库模拟、MGISEQ-2000测序仪上机实操、时空透化实验与透化条件摸索、时空转录本捕获实验等内容。了解更多：理论与实操相结合，华大智造首期DCS平台科研...

RNA-seq学习笔记：第一天 ### RNA-seq转录组生信分析学习笔记：第一天 𐟓œ 中心法则 1958年，弗朗西斯ⷥ…‹里克提出了中心法则（Central Dogma），这是生命科学中最基本和最重要的规律。中心法则指明了遗传信息的流动方向：DNA→DNA（DNA的自我复制），DNA→RNA（转录），RNA→蛋白质（翻译）。大多数生命都遵循这一规律。而RNA病毒中，部分存在RNA→RNA（RNA的自我复制），逆转录病毒则存在RNA→DNA（逆转录）。 𐟓š 转录组能解决什么问题转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的集合。目前转录组测序及分析技术可以解决新基因的深度发掘、低丰度转录本的发现、转录图谱绘制、可变剪接的调控、代谢途径确定、基因家族鉴定及进化分析等问题。 𐟔젨𝬥𝕧𛄧š„建库测序流程组织样取样-提取RNA-去除rRNA-打断，选取特定长度的片段（约300bp）反转录-PCR扩增建库-上机测序。去除rRNA的方法有三种：试剂盒去除（适用于原核生物）、加上一个oligo DT的磁珠富集mRNA、捕获，最常用的是第二种。 𐟓ˆ 转录组数据分析流程原始数据的质控-序列比对（有参）/转录本组装（无参）-基因、转录本表达定量-基因表达差异分析。有参和无参转录组数据分析的关注点有所不同。有参指的是测序物种有参考基因组，关注不同状态下的样本表达量差异；无参指的是物种没有参考基因组，更多的关注转录本的拼接。

𐟌‹ 解读火山图全攻略 𐟔 𐟧 你是否对火山图感到困惑？别担心，这篇指南将带你轻松解读火山图！ 𐟓Š 火山图在基因组、转录组、代谢组和蛋白质组等数据分析中发挥着重要作用。它直观地展示了研究内容的上调、下调及其数量。 𐟒ᠨ磨ﻥ…𓩔𙯼š 1️⃣ 纵轴代表-log10(P-value)，经过DESeq2计算和Benjamini-Hochberg校正，阈值通常设定为-log10(P-value) < 0.05。 2️⃣ 横轴是log2 fold change，图中展示的阈值是绝对值大于1，但实际阈值可根据需求调整。 3️⃣ 颜色代表变化方向：红色表示上调，蓝色表示下调，灰色表示无意义。 𐟔젩€š过火山图，我们可以清晰地看到哪些基因、转录本、代谢物或蛋白质表现出显著的上调或下调。这对于科研工作者来说，是进行数据分析和解读的重要工具。 𐟒ᠧŽ𐥜诼Œ你是否对火山图有了更深入的了解呢？快去试试吧！

滚蛋吧，条带！𐟌€ 在分子生物学研究中，条带问题可是个大麻烦。杂带和条带位置不对，这两种情况都得好好聊聊。杂带问题：蛋白修饰惹的祸𐟐𞊊首先，最常见的原因是蛋白转录和翻译后的修饰。转录后，同一个转录本可能会因为选择性剪切而翻译出不同大小的蛋白，这些蛋白被称为剪接体。在进行实验前，你得仔细比对每个剪接体对目标蛋白结构域的影响，搞清楚到底该检测哪条主带，还是哪几条带。在文献中看到的WB实验图片里，偶尔会出现双条带或多条带，这些都是研究过程中值得解释和讨论的现象。进行Western Blot实验时，你得清楚，针对某些目标蛋白的检测结果并不一定只有一条带。此外，蛋白在翻译完成后可能会进行各种修饰，尤其是糖基化修饰。在一些分泌型蛋白和膜蛋白上，糖基化位点的存在会让一个蛋白的大小增加至两倍或更多。而且，同一个蛋白在不同样本中的糖基化修饰差别很大。有些蛋白有前体和成熟体之分，这种蛋白一般在研究时需要了解。但为了防止信息差，你还是得跟客户解释这个蛋白本身的特性。细胞状态不佳：基因变异惹的祸𐟌€ 另一种情况比较偶发：在细胞培养状态不好或细胞传代过多的情况下，由于基因组的变异，细胞会表达某种蛋白的截短蛋白。这种被截短、剪接后的靶蛋白可能是未经报道的，但由于仍存在抗原识别位点（或抗原表位）而被识别出来。一般情况下，可以通过裁膜避免。等电点的影响𐟓Š 最后，别忘了考虑蛋白的等电点。蛋白质本身是有电荷的，当处于某一个pH值时，蛋白质电荷会被中和，这个数值我们称为等电点pI。大部分蛋白质的等电点小于6，所以在中性的电泳环境中，蛋白因为等电点小于pH值，因此带负电荷。但在某些情况下，蛋白等电点可能大于7甚至接近8，这时由于电泳条件不足以中和电荷，使得蛋白质带正电，在电场中迁移受到阻力，由此产生蛋白分子量变大的错觉。因此，marker仅能作为参考，而实际的主带仍然要结合蛋白特性进行判断。总之，条带问题虽然麻烦，但只要了解了这些影响因素，就能更好地应对了。加油吧！𐟒ꀀ

表观组学与转录组学的奇妙世界表观组学和转录组学是生物学领域的两大研究热点，它们分别关注基因表达和调控的可遗传变化以及RNA转录本的变化。𐟔 表观组学专注于在不改变DNA序列的情况下，通过表观遗传修饰（如甲基化、乙酰化等）来调控基因的表达和性状的变化。这种调控可以在不同的时间和环境条件下发生，从而影响生物体的生命活动。𐟌𑊊转录组学则主要研究RNA转录本的变化、转录调控以及与表观遗传学的联系。它主要关注基因表达的起始阶段，即RNA的合成和修饰过程。而表观组学则更侧重于基因表达的终末阶段，即RNA的翻译和修饰过程。𐟓œ 近年来，随着单细胞测序技术的发展，表观组学和转录组学逐渐结合起来，共同研究基因表达和调控的可遗传变化。这种联合研究不仅有助于我们更深入地理解生命的本质，还为疾病诊断和治疗提供了新的思路和方法。𐟒Š

𐟧쥟𚥛 芯片与高通量测序的对比 𐟔 在基因研究领域，基因芯片和高通量测序技术是两种重要的工具。它们各有特点，适用于不同的研究场景。 𐟒𛠥Ÿ𚥛 芯片，基于探针与目标序列杂交的原理，能够一次性对大量基因进行筛查。它就像一个封闭的系统，主要对已知序列进行检测，非常适合定量分析。而且，它的实验周期通常更短哦！𐟚€ 𐟓š 高通量测序技术则是一个相对开放的系统，不仅能测到已知的序列，还能发现新的序列。这种技术非常适合研究那些参考序列较少的物种，或者想要发现新的转录本和基因表达的可变剪接等情况。𐟔슊𐟒ᠦ€𛧚„来说，基因芯片和高通量测序技术各有千秋。选择哪种技术，完全取决于你的研究需求和目标。无论你是想要快速了解已知基因的表达情况，还是想要深入探索未知的基因世界，总有一种技术会是你得力的助手！𐟌Ÿ

多组学联合分析揭示唐氏综合症新机制最近，意大利技术研究院（Istituto Italiano di Tecnologia, IIT）领导的一个国际科研团队，通过多组学联合分析，发现了唐氏综合症（Down Syndrome, DS）患者大脑中存在的保守细胞投射缺陷。这项研究结合了RNA测序和蛋白质组学分析，为唐氏综合症的脑生理病理学研究提供了宝贵的资源。研究背景 𐟧 唐氏综合症是最常见的遗传性认知障碍之一，其病因是人类21号染色体（HSA21）三倍体。然而，具体的分子机制如何导致DS大脑的各种病理现象，仍然是一个未解之谜。研究人员希望通过多组学分析揭示这些机制，以便为未来的临床干预设计提供新的潜在靶点。研究方法 𐟔슧 ”究团队对来自唐氏综合症患者和健康对照组的脑样本进行了全面的RNA测序和蛋白质组学分析，样本包括海马和皮层两个不同的脑区。研究人员在这两种脑区分别分析了基因、转录本、蛋白质和微小RNA（miRNAs）的表达特征，并使用加权基因共表达网络分析（WGCNA）识别了与DS相关的表达网络。研究发现 𐟌Ÿ 该研究的主要发现包括：基因和转录本表达变化：研究发现，DS脑中大量基因和转录本的表达发生了显著变化。具体而言，研究团队在海马和皮层中分别鉴定出4827个和5548个差异表达基因（DEGs），以及5090个和4718个差异表达转录本（DETs）。蛋白质表达变化：在蛋白质水平上，研究人员在海马和皮层中分别发现了1158个和1029个差异表达蛋白（DEPs）。约40%的DEPs在基因水平上也表现出差异表达，表明转录水平和蛋白质水平之间存在一定的相关性。细胞类型富集分析：通过细胞类型富集分析，研究人员发现上调基因和转录本主要富集在胶质细胞（包括星形胶质细胞、微胶质细胞和少突胶质细胞）。这项研究不仅揭示了唐氏综合症患者大脑中的一些新机制，还为未来的临床干预提供了新的潜在靶点。希望这些发现能帮助我们更好地理解和治疗这种疾病。

北林博士带你玩转科研：从入门到高级技巧嘿，大家好！我是来自北京林业大学（北林）的博士，今天想和大家分享一些关于科研的小技巧和心得。无论你是科研新手还是有一定经验的朋友，希望这些内容能对你有所帮助。科研入门：从零开始首先，对于刚开始接触科研的小伙伴们，我觉得最重要的是保持好奇心和耐心。科研其实就像一场马拉松，不是看你一开始跑得多快，而是看你能否坚持到最后。转录组分析：从入门到精通说到转录组分析，这可是科研中的一大块宝地。无论是基因魔方还是其他科研工具，都能帮你快速上手。比如，有个小工具可以几秒钟内搞定两个样本的转录本表达差异，是不是很方便？还有，从数据到结果，只需3秒！是不是很酷？高效科研：省钱又省心科研是需要花钱的，但怎么才能花得值呢？我有个小秘诀，就是学会优化成本。比如，转录组测序也能省一半的钱，关键是找到合适的方法和工具。这样不仅能省钱，还能提高效率，让你有更多时间去做更有意义的研究。有趣又高效的小工具除了科研工具，还有一些有趣的小软件可以帮你提高效率。比如，有个差异基因分析神器，几秒钟就能搞定两个样本的转录本表达差异。还有，从数据到结果，只需3秒！是不是很方便？这些小工具不仅能让你科研更轻松，还能让你的科研之路更加有趣。科研入门的必看内容如果你是新手，那一定要关注数据分析、SCI写作和绘图这些方面。这些都是科研中必不可少的环节。建议大家收藏一些实用的科研工具和资源，方便以后使用。励志文案：与你共勉最后，分享一些充满力量的句子给大家。生活有进有退，输什么也不能输了心情。加油，与你共勉！希望这些内容能对你有所帮助。

𐟌𑠥𜕧‰騮𞨮᥅覔𛧕导š从理论到实践！引物设计的基本原则 𐟓œ 选择目的基因的共有外显子区域进行设计。引物长度建议在20到25bp之间，GC含量保持在40%到60%，Tm值最好在60℃左右。设计引物时，尽量跨越外显子，上下游引物可以位于不同的外显子上。引物的self complementarity和self 3' complementarity相加值应不超过8，单个值不超过5。扩增产物长度建议在80到300bp之间，最佳为80到150bp。避免设计含有4个或以上相同碱基（如AAAA、TTTT、GGGG、CCCC）的引物，以及避免明显的二级结构。设计流程 𐟖寸使用NCBI在线设计工具：进入NCBI网站，搜索目的基因（如GAPDH）。查看详细信息，找到共有外显子区域。选择转录本信息，查看外显子位置。进入引物设计页面，填写相关信息。设置引物参数，如PCR产物大小、跨越外显子等。点击“Get Primers”获取引物序列。结果解读 𐟓Š 在Graphical view of primer pairs部分查看每对引物跨越外显子的情况。在Detailed primer reports部分查看引物质量和匹配情况。通过以上步骤，你就可以轻松完成引物设计啦！𐟎‰

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